Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r76F8VQ63 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r76F8VQ63 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms