Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
BicraF8VPZ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
BicraF8VPZ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BicraF8VPZ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BicraF8VPZ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms