Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ercc6F8VPZ5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ercc6F8VPZ5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ercc6F8VPZ5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms