Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm20538F6Z9R1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms