Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21974F6W3F3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21974F6W3F3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms