Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r40F6W043 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r40F6W043 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms