Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pagr1bF6V0H0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms