Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sptbn5F6UCX4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn5F6UCX4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms