Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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