Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf212F6TQD1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf212F6TQD1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms