Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3072F6SKY8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms