Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm340F6RGI3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm340F6RGI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms