Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9S5

Gm9964, Predicted gene 9964, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9964E9Q9S5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9964E9Q9S5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm9964E9Q9S5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm9964E9Q9S5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm9964E9Q9S5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9964E9Q9S5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm9964E9Q9S5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9964E9Q9S5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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