Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TrdnE9Q9K5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrdnE9Q9K5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms