Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc146E9Q9F7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc146E9Q9F7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc146E9Q9F7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms