Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd35E9Q9D8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd35E9Q9D8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd35E9Q9D8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd35E9Q9D8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd35E9Q9D8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd35E9Q9D8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ankrd35E9Q9D8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd35E9Q9D8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd35E9Q9D8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms