Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcmdc2E9Q956 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcmdc2E9Q956 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms