Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms