Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col22a1E9Q7P1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col22a1E9Q7P1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col22a1E9Q7P1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms