Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhb9E9Q5G2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms