Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DspE9Q557 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DspE9Q557 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DspE9Q557 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DspE9Q557 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms