Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17727E9Q4V7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms