Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tarbp1E9Q368 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tarbp1E9Q368 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms