Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc4E9Q236 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc4E9Q236 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms