Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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