Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd2E9Q1M1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms