Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ErmardE9Q048 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ErmardE9Q048 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ErmardE9Q048 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms