Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddx60E9PZQ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx60E9PZQ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx60E9PZQ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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