Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph10bE9PYQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph10bE9PYQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.4 ms