Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc17E9PVB5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms