Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim5E9PV98 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms