Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp839E9PUU5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp839E9PUU5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms