Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syde2E9PUP1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syde2E9PUP1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms