Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clca3bE9PUL3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms