Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930407I10RikD3Z5T8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms