Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim12cD3Z3L3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms