Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3676D3Z236 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3676D3Z236 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms