Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc6D3YZP9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc6D3YZP9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc6D3YZP9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms