Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmf1B9EKI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms