Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm1141B9EJU1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm1141B9EJU1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms