Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol6B7ZC55 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol6B7ZC55 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms