Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms