Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia1B2RXQ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms