Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms