Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
1700018F24RikB2RW27 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700018F24RikB2RW27 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms