Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud7bB2RUR8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms