Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AU015836B2RUM3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms