Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN2

Igsf23, Immunoglobulin superfamily, member 23, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf23B2RTN2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf23B2RTN2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf23B2RTN2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf23B2RTN2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf23B2RTN2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf23B2RTN2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf23B2RTN2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf23B2RTN2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf23B2RTN2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igsf23B2RTN2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf23B2RTN2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf23B2RTN2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf23B2RTN2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igsf23B2RTN2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms