Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol7aB2RT54 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol7aB2RT54 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms