Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd5B1AYB6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd5B1AYB6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms